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外顯子測(cè)序
外顯子組測(cè)序（exome-seq）是對(duì)定向富集的*組dna進(jìn)行高通量測(cè)序，它能夠以相對(duì)低的費(fèi)用對(duì)人類外顯子組進(jìn)行拷問。2009年，外顯子組捕獲工具的出現(xiàn)，讓外顯子組測(cè)序這種技術(shù)迅速紅起來。到目前為止，已有超過1萬(wàn)個(gè)外顯子組被測(cè)序。
如今有多家公司推出了外顯子組捕獲*，包括羅氏nimblegen、安捷倫、illumina，還有現(xiàn)在的華大*。這些方法究竟孰優(yōu)孰劣，斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)系的研究人員對(duì)市場(chǎng)上三個(gè)主流的外顯子組測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行了比較。該研究結(jié)果發(fā)表在《nature biotechnology》上。研究人員利用安捷倫、illumina和nimblegen的外顯子組測(cè)序平臺(tái)對(duì)同一個(gè)人類血液樣品進(jìn)行分析。他們的結(jié) 果表明，nimblegen平臺(tái)作為一個(gè)使用高密度重疊探針的平臺(tái)，盡管覆蓋了較少的*組區(qū)域，但在靈敏檢測(cè)小的變異時(shí)所需的測(cè)序量也少。在同樣獲得80m測(cè)序數(shù)據(jù)的情況下，nimblegen有97%的目標(biāo)序列達(dá)到10x以上的測(cè)序深度，而其他產(chǎn)品只有90%。而安捷倫和illumina的探針能夠在低密度下捕獲更多數(shù)量的變異。此外，illumina還捕獲了未翻譯的區(qū)域，這是nimblegen和安捷倫平臺(tái)無(wú)法靶定的。研究人員還比較了同一樣品的外顯子組測(cè)序和全*組測(cè)序（wgs），顯示外顯子組測(cè)序能夠檢測(cè)到wgs錯(cuò)過的小變異。
除了文中提到了三個(gè)主流平臺(tái)，外顯子組捕獲方面的新產(chǎn)品也在不斷推出，熒光定量pcr，研究人員的選擇也將更廣泛。羅氏nimblegen即將推出新一代的外顯子液相捕獲產(chǎn)品。這一新產(chǎn)品將可捕獲64m的*組序列，包括外顯子以及mirna，它含與其他nimblegen液相捕獲產(chǎn)品相同的2.1m高密度探針，以高xiao、均一、特異、的定向捕獲。
染色質(zhì)免l疫共沉淀技術(shù)(chip)
基于體內(nèi)分析而發(fā)展的染色質(zhì)免l疫沉淀分析chr omat in immunoprecipitat ionassay kit， chip)技術(shù)可以真實(shí)、完整地反映結(jié)合在dna序列上的調(diào)控蛋白。由于chip采用甲醛固定活l細(xì)胞或者組織的方法，因此能比較真實(shí)的反映細(xì)胞內(nèi)tf與promoter的結(jié)合情況，還可以用來研究組蛋白的各種共價(jià)修飾與*表達(dá)的關(guān)系。近年來，這種技術(shù)得到不斷的發(fā)展和完善。采用結(jié)合微陣列技術(shù)在染色體*表達(dá)調(diào)控區(qū)域檢查染色體活性，是深入分析*l癥、心血l管病以及**系統(tǒng)紊亂等疾病主要通路的一-種非常有效的工具。
染色質(zhì)免l疫沉淀分析(chip) 的基本原理是在活l細(xì)胞狀態(tài)下，當(dāng)用甲醛處理時(shí)，相互靠近的蛋白與蛋白、蛋白與核酸(dna或rna)之間會(huì)產(chǎn)生共價(jià)鍵。細(xì)胞內(nèi)，當(dāng)f與promoter相互結(jié)合時(shí)，pcr檢測(cè)，它們必然靠的比較近或者契合在一起，這個(gè)時(shí)候用甲醛處理，能使它們之間產(chǎn)生共價(jià)鍵。固定的蛋白質(zhì)dna復(fù)合物通過超聲或酶處理將其隨機(jī)切斷為-定長(zhǎng)度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段然后通過*原*l體的特異性識(shí)別反應(yīng)沉淀此復(fù)合體，特異性地富集目的蛋白結(jié)合的dnal片段，實(shí)時(shí)熒光定量pcr，通過對(duì)目的片斷的純化與檢測(cè)，從而獲得蛋白質(zhì)與dna相互作用的信息。通過qpcr或二代測(cè)序，篩選與目的蛋白互作的未知dna信息。
分子生物學(xué)檢測(cè)
分子生物學(xué)作為現(xiàn)代生物技術(shù)中*為*的實(shí)驗(yàn)手段之一，pcr，已經(jīng)廣泛滲透到生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域，在基礎(chǔ)研究、醫(yī)l療診斷等領(lǐng)域均起到了非常重要的作用。
借助*的技術(shù)優(yōu)勢(shì)，英瀚斯生物特配備了高l效的儀器設(shè)備，如slan 48p 熒光定量pcr檢測(cè)系統(tǒng)、pcr儀、電泳儀、冷凍離心機(jī)、高速離心機(jī)等。目前公司可為您提供反轉(zhuǎn)錄pcr、熒光定量pcr、凝膠電泳遷移率等檢測(cè)服務(wù)，大大縮短您的實(shí)驗(yàn)周期、降低您的實(shí)驗(yàn)成本。
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